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博士Joseph Sang二等权
工程技术学院向论文最佳编写者颁发奖项,过去两年中每一期杂志都发表最佳论文图像: 得克萨斯A&M工程

博士Joseph Sang-II Kwon博士,德克萨斯A&M大学Artie McFerrin化学工程系副教授工程学院执行助理Arul Jayaraman获2021优选论文奖

他们的研究发布第五卷13版4IET系统生物.

生物系统有信号路径-一连串化学反应允许细胞执行细胞分块或细胞死亡等函数数种蛋白质和催化器都参与这些反应中,这增加了开发数学模型的困难性,而数学模型则精确描述这些路径。

此外,获取精确模型的成本可能高工密集度高,而且有关路径的信息往往有限。

研究者用系统生物方法解决该问题,即使用数据聚类综合不同迭代路径,创建基于文献中可用名模模型的时序模型

Kwon说道,“如果你使用这个简单模型处理频繁变化的系统整体,模型精度可能受损”。视时域对模型小小调整,期望精度更高

使用研究者细胞内信号模型启动全局敏感度分析,帮助赋予模型重要性的价值和输入方式对输出和最关键参数产生作用第二,测量数据聚类确定参数取不同值的时间子域最后,最小方问题解决,帮助识别数据集最佳选项

拟方法半数据驱动法,模型构造以可用实验数据及机械模型为指南。具体地说,基于实验数据推断模型参数时间剖面以补充模型因使用标称模型而产生的错配生成模型可提供相对精确预测,尽管对底层系统知识不全同时,机械模型的使用使得生成模型可用于深入分析底层机制,而后台机制很难通过数据驱动模型实现性能。

深入理解核因子kappaB路径(NF-NB)将可设计更具体有效治疗方法处理煽动性疾病

研究者希望以更广泛的容量使用这条路径,因为它显示当数学模型不足以设计实验时使用的潜力

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