理学硕士(M.S.)为学生提供课程和研究训练的结合。有利于技能的培养和技术领导力的建立。尽管大多数学生认为他们在申请博士之前必须先获得硕士学位，但事实并非如此。事实上，以获得博士学位为最终目标的学生被鼓励直接申请德克萨斯农工大学的博士课程。
理科硕士要求
生物医学工程系提供硕士学位，学生在学位计划中完成至少32小时*，其中24小时是正式课程。作为研究型学位的一部分，学生需要撰写并捍卫他们的最终论文，并有一个至少由三名研究生水平的教师组成的委员会，其中一人将是主要顾问。进入该项目的学生必须拥有工程或同等领域的学士学位。(可能需要进修课程。)完整的学位计划和要求可以在下面的PDF中找到。
* 2022年秋季及以后入学的学生在理学学士学位以外的30小时学习时间